Nick V. Grishin: шукати на сайті Z-Library

James O. Wrabl, Nick V. Grishin

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 477 KB

english, 2009

Gaps in structurally similar proteins: Towards improvement of multiple sequence alignment

Журнал:

Sadreyev, Ruslan I, Murray, Mitzi L, Feramisco, Jamison D, Grishin, Nick V, Tsao, Hensin

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 359 KB

english, 2004

Phenotypic and Genotypic Analyses of Genetic Skin Disease through the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) Database

Журнал:

The Journal of Investigative Dermatology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.39 MB

english, 2009

A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action

Kira S Makarova, Nick V Grishin, Svetlana A Shabalina, Yuri I Wolf, Eugene V Koonin

Журнал:

Biology Direct

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 884 KB

english, 2006

BTLCP proteins: a novel family of bacterial transglutaminase-like cysteine proteinases

Krzysztof Ginalski, Lisa Kinch, Leszek Rychlewski, Nick V. Grishin

Журнал:

Trends in Biochemical Sciences

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 201 KB

english, 2004

Genome trees and the tree of life

Yuri I. Wolf, Igor B. Rogozin, Nick V. Grishin, Eugene V. Koonin

Журнал:

Trends in Genetics

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 64 KB

english, 2002

Estimating the number of protein folds and families from complete genome data

Yuri I Wolf, Nick V Grishin, Eugene V Koonin

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 210 KB

english, 2000

SelT, SelW, SelH, and Rdx12: Genomics and Molecular Insights into the Functions of Selenoproteins of a Novel Thioredoxin-like Family †

Dikiy, Alexander, Novoselov, Sergey V., Fomenko, Dmitri E., Sengupta, Aniruddha, Carlson, Bradley A., Cerny, Ronald L., Ginalski, Krzysztof, Grishin, Nick V., Hatfield, Dolph L., Gladyshev, Vadim N.

Журнал:

Biochemistry

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.12 MB

english, 2007

Beclin 2 Functions in Autophagy, Degradation of G Protein-Coupled Receptors, and Metabolism

He, Congcong, Wei, Yongjie, Sun, Kai, Li, Binghua, Dong, Xiaonan, Zou, Zhongju, Liu, Yang, Kinch, Lisa N., Khan, Shaheen, Sinha, Sangita, Xavier, Ramnik J., Grishin, Nick V., Xiao, Guanghua, Eskelinen

Журнал:

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.15 MB

english, 2013

EGFR-Mediated Beclin 1 Phosphorylation in Autophagy Suppression, Tumor Progression, and Tumor Chemoresistance

Wei, Yongjie, Zou, Zhongju, Becker, Nils, Anderson, Matthew, Sumpter, Rhea, Xiao, Guanghua, Kinch, Lisa, Koduru, Prasad, Christudass, Christhunesa S., Veltri, Robert W., Grishin, Nick V., Peyton, Mich

Журнал:

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.33 MB

english, 2013

The WAVE Regulatory Complex Links Diverse Receptors to the Actin Cytoskeleton

Chen, Baoyu, Brinkmann, Klaus, Chen, Zhucheng, Pak, Chi W., Liao, Yuxing, Shi, Shuoyong, Henry, Lisa, Grishin, Nick V., Bogdan, Sven, Rosen, Michael K.

Журнал:

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.64 MB

english, 2014

A Single Kinase Generates the Majority of the Secreted Phosphoproteome

Tagliabracci, Vincent S., Wiley, Sandra E., Guo, Xiao, Kinch, Lisa N., Durrant, Eric, Wen, Jianzhong, Xiao, Junyu, Cui, Jixin, Nguyen, Kim B., Engel, James L., Coon, Joshua J., Grishin, Nick, Pinna, L

Журнал:

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.06 MB

english, 2015

Absence of TLR11 in Mice Does Not Confer Susceptibility to Salmonella Typhi

Song, Jeongmin, Wilhelm, Cara L., Wangdi, Tamding, Maira-Litran, Tomas, Lee, Seung-Joo, Raetz, Megan, Sturge, Carolyn R., Mirpuri, Julie, Pei, Jimin, Grishin, Nick V., McSorley, Stephen J., Gewirtz, A

Журнал:

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 342 KB

english, 2016

The Ancient Gamete Fusogen HAP2 Is a Eukaryotic Class II Fusion Protein

Fédry, Juliette, Liu, Yanjie, Péhau-Arnaudet, Gérard, Pei, Jimin, Li, Wenhao, Tortorici, M. Alejandra, Traincard, François, Meola, Annalisa, Bricogne, Gérard, Grishin, Nick V., Snell, William J., Rey,

Журнал:

Nelson, Erik, Grishin, Nick

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.15 MB

english, 2017

The complete mitogenome of Euschemon rafflesia (Lepidoptera: Hesperiidae)

Zhang, Jing, Cong, Qian, Shen, Jinhui, Fan, Xiao-Ling, Wang, Min, Grishin, Nick V.

Журнал:

Mitochondrial DNA Part B

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 1009 KB

english, 2017

How Often Do Protein Genes Navigate Valleys of Low Fitness?

Журнал:

Genes

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 523 KB

english, 2019

Crystallization and preliminary X-ray studies of ornithine decarboxylase fromTrypanosoma brucei

Grishin, Nick V., Osterman, Andrei L., Goldsmith, Elizabeth J., Phillips, Margaret A.

Журнал:

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 222 KB

english, 1996

Crystal structure of YbaK protein from Haemophilus influenzae (HI1434) at 1.8 Å resolution: Functional implications

Hong Zhang, Kui Huang, Zhong Li, Linda Banerjei, Kathryn E. Fisher, Nick V. Grishin, Edward Eisenstein, Osnat Herzberg

Журнал:

Michael Y. Galperin, Nick V. Grishin

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 747 KB

english, 2000

The synthetase domains of cobalamin biosynthesis amidotransferases cobB and cobQ belong to a new family of ATP-dependent amidoligases, related to dethiobiotin synthetase

Журнал:

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 873 KB

english, 2000

GGDEF domain is homologous to adenylyl cyclase

Журнал:

Monica M. Horvath, Nick V. Grishin

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 478 KB

english, 2001

The C-terminal domain of HPII catalase is a member of the type I glutamine amidotransferase superfamily

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 560 KB

english, 2001

Protein side chain modeling with orientation-dependent atomic force fields derived by series expansions

Shide Liang, Yaoqi Zhou, Nick Grishin, Daron M. Standley

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 210 KB

english, 2011

COG4849 is a novel family of nucleotidyltransferases

Bong-Hyun Kim, Ruslan Sadreyev, Nick V. Grishin

Журнал:

Journal of Molecular Recognition

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.15 MB

english, 2005

A comprehensive update of the sequence and structure classification of kinases

Sara Cheek, Krzysztof Ginalski, Hong Zhang, Nick V Grishin

Журнал:

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.66 MB

english, 2005

Structure of a conserved hypothetical protein SA1388 fromS. aureusreveals a capped hexameric toroid with two PII domain lids and a dinuclear metal center

Kumar Singh Saikatendu, Xuejun Zhang, Lisa Kinch, Matthew Leybourne, Nick V Grishin, Hong Zhang

Журнал:

S Sri Krishna, Ruslan I Sadreyev, Nick V Grishin

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.43 MB

english, 2006

A tale of two ferredoxins: sequence similarity and structural differences

Журнал:

Ruslan I Sadreyev, Nick V Grishin

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.15 MB

english, 2006

Exploring dynamics of protein structure determination and homology-based prediction to estimate the number of superfamilies and folds

Журнал:

Lukasz Knizewski, Lisa N Kinch, Nick V Grishin, Leszek Rychlewski, Krzysztof Ginalski

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.40 MB

english, 2006

Realm of PD-(D/E)XK nuclease superfamily revisited: detection of novel families with modified transitive meta profile searches

Журнал:

Nick V. Grishin, Margaret A. Phillips

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 761 KB

english, 2007

CREST - a large and diverse superfamily of putative transmembrane hydrolases

Jimin Pei, Douglas P Millay, Eric N Olson, Nick V Grishin

Журнал:

Biology Direct

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.06 MB

english, 2011

The subunit interfaces of oligomeric enzymes are conserved to a similar extent to the overall protein sequences

Журнал:

Nick V. Grishin, Margaret A. Phillips, Elizabeth J. Goldsmith

Рік:

1994

Мова:

english

Файл:

PDF, 390 KB

english, 1994

Modeling of the spatial structure of eukaryotic ornithine decarboxylases

Журнал:

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.37 MB

english, 1995

C-terminal domain of gyrase A is predicted to have a β-propeller structure

Yuan Qi, Jimin Pei, Nick V. Grishin

Журнал:

Lisa N. Kinch, Nick V. Grishin

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.34 MB

english, 2002

Expanding the nitrogen regulatory protein superfamily: Homology detection at below random sequence identity

Журнал:

Lisa N. Kinch, David Baker, Nick V. Grishin

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.91 MB

english, 2002

Deciphering a novel thioredoxin-like fold family

Журнал:

Shide Liang, Nick V. Grishin

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 970 KB

english, 2003

Effective scoring function for protein sequence design

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 336 KB

english, 2004

CASP5 target classification

Lisa N. Kinch, Yuan Qi, Tim J. P. Hubbard, Nick V. Grishin

Журнал:

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.35 MB

english, 2003

CASP5 assessment of fold recognition target predictions

Lisa N. Kinch, James O. Wrabl, S. Sri Krishna, Indraneel Majumdar, Ruslan I. Sadreyev, Yuan Qi, Jimin Pei, Hua Cheng, Nick V. Grishin

Журнал:

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.04 MB

english, 2003

Combining evolutionary and structural information for local protein structure prediction

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 310 KB

english, 2004

Structural classification of thioredoxin-like fold proteins

Yuan Qi, Nick V. Grishin

Журнал:

Mingzhu Zheng, Krzysztof Ginalski, Leszek Rychlewski, Nick V. Grishin

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.04 MB

english, 2005

Protein domain of unknown function DUF1023 is an α/β hydrolase

Журнал:

James O. Wrabl, Nick V. Grishin

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 370 KB

english, 2005

Grouping of amino acid types and extraction of amino acid properties from multiple sequence alignments using variance maximization

Журнал:

Hua Cheng, Bong-Hyun Kim, Nick V. Grishin

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 246 KB

english, 2005

MALIDUP: A database of manually constructed structure alignments for duplicated domain pairs

Журнал:

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 220 KB

english, 2008

The Rho GTPase inactivation domain in Vibrio cholerae MARTX toxin has a circularly permuted papain-like thiol protease fold

Журнал:

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 259 KB

english, 2009

CASP9 assessment of free modeling target predictions

Lisa Kinch, Shuo Yong Shi, Qian Cong, Hua Cheng, Yuxing Liao, Nick V. Grishin

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 914 KB

english, 2011

CASP9 target classification

Lisa N. Kinch, Shuoyong Shi, Hua Cheng, Qian Cong, Jimin Pei, Valerio Mariani, Torsten Schwede, Nick V. Grishin

Журнал:

Journal of Molecular Evolution

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.12 MB

english, 2011

Estimation of the number of amino acid substitutions per site when the substitution rate varies among sites

Nick V. Grishin

Журнал:

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 358 KB

english, 1995

Estimation of evolutionary distances from protein spatial structures

Nick V. Grishin

Журнал:

Journal of Molecular Evolution

Рік:

1997

Мова:

english

Файл:

PDF, 781 KB

english, 1997

A Novel Approach to Phylogeny Reconstruction from Protein Sequences

Nick V. Grishin

Журнал:

Journal of Molecular Evolution

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 338 KB

english, 1999

A minimal domain responsible for Munc13 activity

Basu, Jayeeta, Shen, Nan, Dulubova, Irina, Lu, Jun, Guan, Rong, Guryev, Oleg, Grishin, Nick V, Rosenmund, Christian, Rizo, Josep

Журнал:

Nature Structural and Molecular Biology

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 157 KB

english, 2005

Peptidase family U34 belongs to the superfamily of N-terminal nucleophile hydrolases

Журнал: